Visi

Sekolah Menengah Sains Sultan Iskandar Sekolah Unggul Penjana Generasi Terbilang

Misi

Membangun Potensi Individu Melalui Pendidikan Berkualiti

Matlamat

1. Berusaha menyediakan peluang pendidikan berkualiti kepada pelajar bagi memastikan kecemerlangan pelajar ke institusi pengajian tinggi.
2. Mewujudkan iklim persekolahan yang konduksif dan budaya yang berkonsepkan “Sekolahku Rumahku Syurgaku”
3. Melahirkan pelajar yang mempunyai kecemerlangan bakat dan kepimpinan, sahsiah terpuji dan semangat patriotik yang padu dan bertanggungjawab.
4. Menghasilkan pelajar yang progresif, inovatif dan bijaksana bagi merealisasikan Wawasan 2020.
5. Menghayati kecemerlangan matlamat Sekolah Berasrama Penuh kepada seluruh warga Sekolah Menengah Sains Sultan Iskandar.